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发表于 2016-10-12 11:35:42
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研究人员使用 GPU 研究埃博拉病毒
2016 年 10 月 7 日
       新消息:来自伊利诺伊大学香槟分校和斯坦福大学的研究团队正在美国国家超级计算应用中心(NCSA) 使用 Blue Waters 超级计算机预测最有可能与病毒包膜蛋白实现最佳配对的抗体。此项研究聚焦于埃博拉病毒的两种毒株和两种毒株可能存在的多种突变体。
通过在超级计算机中使用 CUDA 和 NVIDIA Tesla 加速器,研究人员模拟了埃博拉病毒的进化和最有可能出现的将对抗此类进化的抗体突变。事实上,这是一个反复试验的过程,在进化到有抵抗力的过程中,会有许多人死亡。
       团队研究员同时也是 NCSA 高级研究员的Eric Jakobsson 希望能够“走捷径”,并与生物技术行业合作设计可大规模生产的合成抗体。

Blue Waters 是世界上超强大的超级计算机之一,它使用成千上万的计算核心达到每秒超过1.3 万万亿次计算的峰值性能。

       埃博拉不是该团队关注的唯一病毒 - 下一个研究对象是流感病毒。
     “人们携带着病毒在世界各地流动。对抗世界各地的病毒感染符合发达国家的利益,因为我们不是孤立的,”Jakobsson 说。“我们不能有效隔离自己。因此从自身利益出发,以及从正义的角度出发,我们应着手解决世界各地的病毒感染问题。”



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