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发表于 2019-12-24 15:44:12
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NVIDIA Parabricks:  加速基因分析,将几天时间降低到1个小时
在新医疗仪器的帮助下,测序成本大幅下降:几乎每隔6个月,我们就会看到像BGI的DNBSEQ-T7这样的高通量新仪器,每天有60个基因组。按照目前的基因测序速度,到2025年,本行业将产生超过20E(1EB = 1024PB) 的数据量。这将超过了Twitter, Youtube,和天文这三个行业所产生的数据量总和。事实上,每个云中的所有CPU都需要200多天才能进行基因组分析。
Parabricks是密歇根州安阿伯市的一家初创公司,它开发了一种基于GPU的解决方案,该解决方案加速了从天到小时分析整个基因组的过程--人类染色体上的所有30亿个碱基对。随着平台生成更多的数据,数据分析已经成为时间和成本方面的一个主要瓶颈,Parabricks的解决方案解决了这两个障碍。
今天,Parabricks正式加入了NVIDIA医疗行业团队,将继续推进GPU加速的基因组分析。
NVIDIA医疗副总裁Kimberly Powell说:“随着国家测序计划、临床基因组学和个性化医疗的发展,对下一代测序的需求越来越大。”“我们很高兴Parabricks团队加入NVIDIA,并加倍努力提供快速和准确的基因组分析工具,将基因组学提升到一个新的水平。”
Parabricks的GPU加速处理流程组合,涵盖了流行的行业用例。包括加速诸如:GATK体细胞突变分析,GATK生殖细胞突变分析,和基于深度学习的突变识别(variant calling)和拷贝数突变分析。整个分析流程可以让用户体验到,几个数量级的加速,同时整个流程还能保证生成和标准工具相同的100%精确的结果。团队已经将这套加速工具都进行了容器化,可以广泛部署在主要的公有云上,和用户自有的本地设备上。以及,到明年(2020年),Parabricks将会发布适用于单细胞和RNA处理流程的解决方案。随着Parabricks在临床领域的广泛应用,它将在这些现有产品的基础上提供临床级的软件。--------------------------
使用新的Isaac SDK版本2019.3模拟和创建智能室内机器人
NVIDIA 发布全新版本 Isaac 软件开发套件(SDK),为机器人提供更新的AI感知和模拟功能。
NVIDIA 创办人暨执行长黄仁勋在 NVIDIA 最新的中国 GPU 技术会议(GTC CHINA 2019)上宣布了该消息。在建立统一的机器人开发平台以实现 AI、模拟和操控功能方面,Isaac SDK 迈出了重要的里程碑。
Isaac SDK 包括 Isaac Robotics Engine(提供应用程序框架),Isaac GEM(预先构建的深度神经网络模型、算法、程序库、驱动程序和 API),用于室内物流的参考应用程序以及 Isaac Sim 的第一个版本(提供导航功能)。
全新 Isaac SDK 可以大大加快研究人员、开发人员、新创企业和制造商开发和测试机器人的速度。它使机器人能够通过模拟获得由人工智能技术驱动的感知和训练功能,从而可以在各种环境和情况下对机器人进行测试和验证。
点击“阅读原文”了解更多开发者新闻。

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